Hostia, ktorí dlhodobo užívajú lieky predpísané svojimi domácimi ošetrujúcimi lekármi, pokračujú v užívaní i v kúpeľoch. V mnohých prípadoch je však možné množstvo užívaných liekov v priebehu kúpeľnej liečby zredukovať. Ide predovšetkým o lieky na tlmenie bolesti, svalového napätia či rôzne psychofarmatiká, niekedy i lieky proti vysokému tlaku.
Počas kúpeľnej liečby je pre pacientov zabezpečená nutná medikamentózna terapia, pokiaľ to ich zdravotný stav vyžaduje.